可是一见面，李膺就踌躇了，这个孩子他真的没见过。李膺毕竟是名震天下的大名士，于是含笑问道：“您的祖上，与我有何通家之好？” 孔融从容答道：“当然，吾祖孔夫子，与大人您的祖上李老君同德比义，互为师友，所以，融与大人累世通家。
一番话，说得李校尉和坐中宾客大为惊叹，这个娃娃真聪明！李校尉觉得有趣儿，又来逗他，指着桌上的水果说：“您想吃点儿什么吗？”“想吃。”“您原来不知道做客的礼节，主人问吃什么，一定要谦让。”可是孔融反唇相讥道：“大人原来也不知道做主人的礼节，主人布设食物，是不能问客人吃不吃的。”
坐中有太中大夫陈韪，也出来逗他说：“小时了了，大时未必。”“看来，这位大人小时候一定很愚钝吧。”这个小机灵，逗得大家哈哈大笑。李校尉长叹一声：“卿将来必为伟器，可惜我老了，看不到您有成就的那一天了！”
第三件，便是收留张俭，这个张俭，就是前面提过的“荆襄八俊”之一。
十三岁时，孔宙去世，孔融悲痛过度，需要人扶才能站起来，州里因而称赞他的孝行。这时名士张俭为中常侍侯览所记恨，密令要州郡捉拿张俭。张俭与孔融兄长孔褒是好友，于是逃到孔褒家中，孔褒却不在。
出门迎接他的是一个十五六岁的孩子，告诉张俭，家兄孔文礼出远门儿了。张俭间此人如此年幼，不便多言，打算马上离开。可是小孩儿却开口了：“先生请留步！兄虽在外，难道我不能做主人吗？”说着，将张俭让进门来。
张俭知道孔都尉三年前就过世了，孔家唯有高堂健在，孔氏兄弟七人，这一位不知排行第几，连忙开口相问。小孩儿答道：“小弟名融，排行第六。”“原来是孔文举，文礼向我提过你，说你有异才，今日见君，果然不同凡响！”
后来事情泄漏，自国相以下的人，都秘密的压下此事，张俭得以逃脱，孔褒、孔融则被逮捕入狱。但不知他们二人是谁获罪。孔融说：“收容匿藏张俭的是我，有罪归我。”孔褒说：“张俭来找我，不是弟弟的罪过，罪在我，我心甘情愿。”
官吏问他们的母亲，母亲说：“年长的人承担家事，罪责在我。”一门都争着赴死，郡县迟疑不能决断，于是向朝廷请示。诏书最后定了孔褒的罪，孔融因而闻名，与平原陶丘洪、陈留边让齐名，州郡以礼策命，都不到。
后来，孔融受司徒杨赐征召，当时暗暗察访官僚中的贪污之人，准备予以贬谪罢免，孔融检举的多为宦官的亲族。尚书害怕得罪宦官，于是召孔融等司徒属官诘问斥责，孔融陈述宦官子弟的罪恶，毫不隐讳。
光和七年，河南尹何进即将升任大将军，杨赐派孔融拿着名片去祝贺何进，因门人未及时通报，孔融就把名片夺回，引罪自责而去。河南尹官属认为丢了面子，想要派剑客追杀孔融，有宾客对何进说：“孔文举有盛名，将军如果与他结怨，四方之士就会相随而去了。不如以礼对待他，使天下人都知道将军的胸怀广大。”
何进同意，于是在受任大将军之后，征辟孔融，举其为高第，迁任侍御史。孔融又因为与上司御史中丞赵舍不和，托病归家。 后来，孔融被征为司空掾属，授任北中军候。在职三天，转任虎贲中郎将。
正逢董卓总揽朝政，想要废掉少帝刘辩，孔融与董卓争辩，言辞激辩，常有匡正之言。董卓怀恨在心，将孔融转任议郎，随后又暗示三府举荐孔融，到黄巾军最为猖獗的北海国为相。 孔融到北海后召集士民，聚兵讲武，下发檄文，又亲写书札，与各州郡通声气，共同谋划。因讨伐黄巾军张饶战败，而转保朱虚县。
慢慢集结官吏百姓被黄巾所蛊惑的男女四万多人，再设置城邑，设立学校，表显儒术，荐举贤良郑玄、彭璆、邴原等。对待国人，就算只有一点微小的善行，也都以礼对待。国人没有后代及四方游士有去世的，都帮助安葬他们。因颇有政声，被时人称为“孔北海”。
孔融在北海，自认为智计无双，溢才命世，当时的英雄豪杰都比不上自己。整军经武、修葺甲兵，据北海为根本，不肯像寻常太守一般，碌碌无为。对郑玄礼遇甚恭，称之为郑公而不名，执子孙礼。高谈阔论，言辞典雅，有高屋建瓴之势。
可是一办起事儿来，去什么都做不成，北海郡管理得极其混乱，甚至连赋税都收不上来。不得已迁怒到督邮身上，一天杀了五部督邮。底下的贪官污吏，他也毫无办法，只能任其横行。眼高手低，志大才疏，如孔北海一般，就是大汉清流的典型！