月球和火星基地，以及星际星舰爆炸之时，白严异正在撤退的航天飞机上，飞机刚冲出平流层，机长就看到了月球上空灼目的爆炸光芒，知道月球基地出事了，于是将飞机折返回地球。白严异因此逃过一劫，得以继续担任联合区总统。
联合区围绕着几个军事基地，重新建立总部，据点，民众安置点，同时正式开始了与曼得拉的拉锯反击以及游击战。
混乱间隙里，顾朝阑还要求联合区分出部分武力，收集全市机器人，并进行销毁。这是一个不小的工程，联合区一开始只同意给出一百个人，在顾朝阑的强势要求之下，改成了一千人。
关于联合区电力恢复的问题，顾朝阑和白严异意见不统一。
顾朝阑反对恢复电力，但白严异迫切希望恢复，好夺回联合区的武器控制程序，恢复火力以驱逐曼得拉组织。经过数次开会争吵之后，联合区最终决定恢复电力。
电力在一个月之后恢复。
随着电力恢复，联合区的武器系统，能源补给接连复苏，于是武器落后，组织散漫，行事暴戾的曼得拉很快败在了联合区的高科技，高威力武器之下。
顾朝阑所担心的机器人和机甲叛变并没有发生。
将曼得拉从联合区首都卡菲市驱逐出去，只花了半个月。
电力恢复后，通讯也逐步回归正常。顾朝阑这个时候才知道，不仅仅是西亚联合区，其他四个联合区也不同程度的受到了地球灭亡恐慌，停电，以及曼得拉阶层清洗行动的影响。
全球八成的天空城堡因断电坠毁，剩下的两成则被曼得拉组织炸毁。曾经的空中城市不复存在，大量的城市沦为废墟，陷入混乱。
而随着电力逐步恢复，混乱也渐渐平息，曼得拉组织被清理，灭杀，驱赶。他们带来的混乱和杀戮也慢慢结束，各大联合区带领着人民从废墟里捡起希望，重新建立秩序与家园。
至此，持续四十五天的第二次大混战结束。
2224年2月21日，白严异宣布西亚联合区更名新西亚共和联合区，取消四级公民制度，人人平等。
曼得拉组织先是被赶出市区，然后是原地一层，直至暂时销声匿迹。
期间，新联合区将胶囊定为新型毒品，凡售卖，服用者皆以枪毙论处。
两个月后，曼得拉基本在原地一层区域消失，新居民被分配进来，同时，新联合区先后颁布多项新法令，并取消了旧联合区时期的各种歧视和不公平规定，试图建立一个和谐平等的新社会。
大混乱终于结束，尽管新联合区仍旧满地废墟，百废待兴，但也同时浴火重生，拉开了一个崭新的，更平等的新时代帷幕。