而这时，在盐帮的内部，老总舵主朱忠已死，死因是遭人暗杀，兇手不明，于是由女儿朱瑛接手总舵主，由左护法严铁辅佐，引起由右护法勾峰为首的部分分舵势力的不满，严铁怀疑，正是勾峰勾结富顺官员欺上瞒下，以多报少中饱私囊，还联合漕运使鱷渊打劫官船，陷害善良盐户，后怕被发觉而买兇杀害朱忠。
五月，就在包芳积极查案的同时，锦衣卫已经将此案的精要写成密摺直接呈报给煌羽帝，当煌看过整起案卷之后，却对其中的细节產生怀疑，另一方面，包芳在整合情报后则认定是盐帮因为私盐利益，抢劫富顺盐铁转运使的运盐官船然后栽赃包蛮，接着为了湮灭证据而杀害调查官员以防消息走漏的可能性比较大。
六月，朱瑛和严铁也双双前往富顺想要为父报仇，锦衣卫将状况回报，煌于是决定派出高石阿武亲自督军，严密监控富顺区盐业矿產区梓县，然后又再度微服，假扮盐商二公子，以视察盐矿为由潜伏富顺并下旨停掉包蛮的所有职务，这招让富顺官员全乱了套。
包芳与易可言到驛馆拜见煌，煌再次劈头臭骂易可言，如此案件工部派了多少官员去查，均如泥牛入海，锦衣卫介入调查才没几天呢，明明白白，易可言向煌认罪，包芳则是为易可言在驾前圆融，煌这才先暂时放过，和两人彻夜讨论案情。
七月，包芳得知盐帮总舵主朱瑛也来到了梓县，于是想尽办法与两人相见，取得事情的来龙去脉，朱瑛怀疑是包蛮勾结勾峰刁三引发这次事件，包芳对于这一假设推断又是一次震惊，于是双方决定联合调查，然后将煌也来到此地的事情也说与他们，朱瑛吃惊，忙问是那个与家父朱忠结拜的义叔袁洪锋齐名的八神煌吗，包芳提醒，此乃当今皇上，两人吓一跳，一国之君居然如此重视百姓，为了此事竟微服私仿。
朱瑛与严铁在包芳的引荐之下，受到煌的召见，于是整件事情都清清楚楚，此时勾峰手下盐帮梓县分舵主刁三见朱瑛等人来到，担心东窗事发，急找勾锋商讨对策，不意竟遭勾锋派唐飞将其灭口，而唐飞，正是整起案子的兇手，原来前总舵主之死即是勾锋买通唐飞所为，两人为了隐瞒一切罪行，决定不择手段，此举被锦衣卫牢牢的盯住，煌获悉之后，採取以退为进之策，下达一道暗旨，将包蛮押解回京打入詔狱，朱瑛与严铁决定暗中跟随并期待兇手现身但是愿望漏空，一路上是谁也没有出现。
八月，詔狱内，包芳奉旨审讯，质问包蛮为何犯案，包蛮反问包芳，两个人同喝其母的奶水长大，如何会有不同的人品，声称是遭人诬陷，要包芳务必彻查，还他清白，另一方面，朱瑛等人回到盐帮，仍查不出施打暗器之人，显示包蛮并非杀人灭口的对象，于是将此事告诉包芳。
包芳急回朝向煌表明包蛮清白，岂料煌表示这也代表包蛮可能就是主使者，自然不会杀了自己灭口，包芳洩气，继续查办，包芳左右为难，若判包蛮无罪则为循私，若包蛮有罪则须兄弟相残，又将被批为沽名钓誉罔顾人伦，但在妻子开导下，决定不预设立场，持续追查使用暗器之凶手，终于逼唐飞现形，并欲杀包芳朱瑛等人灭口，但随即全部被锦衣卫给抓住并且全数押往詔狱。
二十五日，锦衣卫衝进漕运衙门，逮捕漕运使鱷渊庚司、护漕使藤江竹彦、护漕使石飞一也、梓县知县安德路在内的漕运上下大小官员共五十二名，然后，于其据点中找到了两年来他们所劫持的官盐，一共是八百万石。
九月，一干共犯终于陆续落网，煌于詔狱夜审勾峰与唐飞，两人供认不讳，证据不足下，包蛮被判无罪。严铁发现勾锋账本，查出收受赃银均有暗记，包芳这才发现原来包蛮的行李中发现铸有同样暗记的银两，包蛮的确涉案，而且还是主谋。
九月，包蛮被再次下狱，这时两人老母亲闻风现身，在詔狱门口跪求包芳放过包蛮一命，包芳则以当初娘教诲无愧于天亦跪求娘成全，妻子眼见包芳为难，心中暗下决定，绝不让丈夫背负六亲不认的骂名，包蛮最终死在牢中，包芳之妻亦服毒自尽，包芳在伤心之于慨然写下包家家训，期勉包家后世子孙永不涉贪。
多日死气沉沉的淮河终于復甦通航了，沉寂了近两年的大运河，又喧嚣了起来，富顺两岸的百姓们终于可以吃到朝廷的平价官盐了，煌望着宽阔的河面，心情久久不能平静。
十月，煌便针对此案做出了了结，将犯一干事主从共犯全部凌迟处死并且抄家，后包芳进京述职，向煌推荐儿子包有文与包有道，随即向朝廷提出辞呈，煌强烈的予以慰留，但是包芳退意坚决，于是授予一金和三眼花翎，让其光荣退休，至于易可言，煌下旨将其贬为台湾县知县，步当年范仲亭的后尘，这件事件就这样子告一段落，史官将案情命名为「富顺盐案」。