「明南三宫」第一宫，是皇帝在南京的寝宫，煌下榻南京时便在此办公，面阔9间，进深5间，重簷廡殿顶。
#天乾殿：养心宫中轴线的后正方，煌在南京的召幸场所。
#首理堂：是歷任首理寝宫，位于天乾宫东侧，面阔5间，进深3间，为陪室。
#首理室：是歷任首理之子、孙子寝宫，位于天乾宫西侧，面阔5间，进深3间，为陪室。
+椒房宫
「明南三宫」第二宫，是皇后在南京的寝宫，是南京后宫的建筑主体，面阔9间，进深5间，重簷廡殿顶。
#柔仪殿：坤懿宫中轴线的后正方，慈仁皇后美美在南京的日常办公的场所。
#夫人堂：是歷任首理夫人与小妾寝宫，位于坤寧宫东侧，面阔5间，进深3间，为陪室。
#小姐室：是歷任首理之女、孙女寝宫，位于坤寧宫西侧，面阔5间，进深3间，为陪室。
+春和宫
「明南三宫」第三宫，是太子、皇子、太孙、皇孙在南京的寝宫，东宫有宝座、龙床，床皆五彩雕鏤，宫前多植梅树。
#东宫殿：春和宫中轴线的后正方，太子在南京的日常办公的场所。
#怀柔堂：是太子妃与太子侧妃寝宫，面阔5间，进深3间，为陪室。
#怀柔室：是太子之女与太子之孙女寝宫，面阔5间，进深3间，为陪室。
+南东六宫
是陪驾皇帝南巡嬪妃的住所，位于后宫坤懿宫中轴线的东侧，与南西六宫相对，是一组由六个相同形式的院落组成的建筑。
+南西六宫
是陪驾皇帝南巡嬪妃的住所，位于后宫坤懿宫中轴线的西侧，与南东六宫相对，是一组由六个相同形式的院落组成的建筑。
*南花园
是南京的御花园，周围有城墙和东西南北四门，面积约一万馀平方公尺，布局紧凑，建筑福利，相当幽雅，内容物有：
@承光门：南花园东门
@顺贞门：南花园西门
@延和门：南花园南门
@集福门：南花园北门
+万岁山
+钦安殿
+絳雪轩
+养性斋
+万春亭
+千秋亭
+浮碧亭
+澄瑞亭
+堆秀山
+延暉阁
+摛藻堂
+位育斋
+凝香亭
+玉翠亭
+四神祠
+太稷
在南花园东门承光门之东，庙前有石桥，门内有东西井亭，太庙丹陛三重，殿宇九间，内设诸佛法像，面南一位，面东三位，面西三位。
#方丘：是皇帝祭“天”之所，位于正阳门外鐘山之阳。
#大祀坛：围墙四面均设有櫺星门，圜丘内还建有望祀殿，其东面建有庙宇、西面建有斋宫，内部收纳祭祀社稷的灯罩、三牲五果、御用沉香等祭祀用品。
+太庙
在南花园西门顺贞门之东，南京的奉先殿，大曌皇族在南京祭祖之所，殿内有斋宫，各有灵床，床左右悬悬灯，床前素壁，壁前各设方木椅，椅上籍黄褥，褥上各设裳衣，椅麓设履，歷代皇帝的灵位。
#圜丘：是皇帝祭“地”之所，位于太平门外鐘山之阴。
#社稷坛：围墙四面均设有櫺星门，圜丘内还建有望祀殿，其东面建有牌位、西面建有斋宫，内部收纳祭祀社稷的灯罩、三牲五果、御用沉香等祭祀用品。
+山川坛
是皇帝祭祀山川的祭坛，内有日坛、月坛、星辰坛、月将坛、太岁坛、先农坛、祈雨坛。
+神乐观
负责国家祭祀礼乐的机构，也是国家最高音乐教育机构，负责对王府以及附属国的音乐教化，有山门、两边角门、高真大殿、两边画廊、祠堂、食堂、东岳殿、十王殿、住房殿、提点公殿、醴泉亭、来鹤亭、铜云板房、仓房等房屋100馀间，道院148房。
+温泉
在南花园北门集福门之东，是南京的皇家沫浴休息场所，内部也有和北京一样的一整套温泉汤浴群：
#星辰汤：皇帝、皇后专用浴池，为混和汤浴。
#海棠汤：嬪妃、采女专用浴池。
#莲华汤：亲王、皇子、贝勒、贝子专用浴池。
#莲花汤：内亲王、公主、郡主、郡君专用浴池。
#药膳汤：是太皇太后、皇太后专用浴池，可自由调配各种养生汤浴。
+黄册库
在南花园北门集福门之西，专门收贮全国赋役档案的中央档案库，同时藏有全国丈量土地绘製的鱼鳞图册。
+麟德殿
位于大明宫的最南部，是宫内规模最大且位置最南方的宫殿，建于圣祖煌羽二十年到二十三年之间，是皇帝举行宴会、观看乐舞和接见外国使节的场所。